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构建有潜在高亲和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-变形杆菌(USCα)的基因

文章来源:撰稿/供图:王越  |  发布时间:2020-01-16  |  【打印】 【关闭

  近日,地外海洋系统研究室与普林斯顿大学地球科学系Tullis C. Onstott教授研究团队合作在国际期刊《Microbiology Resource Announcements》上发表了题为“Metagenome-Assembled Genome of USCα AHI, a Potential High-Affinity Methanotroph from Axel Heiberg Island, Canadian High Arctic”的论文。hot88所刘翠艳研究员为通讯作者。 

  该研究团队在2011-2013年期间在加拿大北极高地海伯格岛(Axel Heiberg IslandAHI)检测到含低碳的冻土夏季时分是甲烷汇,并在2015-2016年报道了AHI融冻层含活跃的微生物,负责氧化空气中低甲烷浓度的微生物丰度非常低(~1%)。不过,这些高亲和力的甲烷氧化菌未被培养和分离。

  本研究从21个融冻层的实验样品提取的宏基因组数据,通过拼接手法,构建了有潜在高亲和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-变形杆菌(USCα)的基因组,从而揭示其生理和生长需要。   

  

  

  拜叶林克氏菌科甲烷氧化菌与USCα AHI的基因组比较(Rusley et al.,2019

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